合同上有修改痕迹不一定作废，若合同当事人协商一致修改的，合同仍然有效。修改过的合同也能起诉，但需要符合起诉条件，包括有明确的被告；有具体的诉讼请求、事实、理由。
一、
合同上有修改痕迹作废吗
合同上有修改痕迹不一定作废，只要是双方真实的意思表示，是有效的。合同签订后任何一方想修改的，需要与对方协商一致，重新签订合同或在原合同相应条款作修改或补充，并在修改地方加盖双方公章或按手印。
《民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。
二、
修改过的合同能起诉吗
找法网提醒，修改过的合同也能起诉，当事人的起诉权利不因为合同的修改而丧失，只要当事人的起诉符合法律规定的起诉条件，既可以向有管辖权的法院提起诉讼。不论其修改合同是双方当事人合法协商一致修改的还是单方私自修改的，都有权起诉。
根据《民事诉讼法》第一百一十九条规定，起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
三、
合同修改后的诉讼时效
是3年，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《民法典》第一百八十八条 【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。