公司搬迁员工是有赔偿权利，如果员工原因跟随公司进行搬迁，公司需要支付员工拆迁安置费；如果因为搬迁导致解除劳动合同，需要支付相应的经济补偿。公司搬迁员工赔偿金要扣税的。
一、
公司搬迁员工是否有赔偿权利
公司搬迁员工是有赔偿权利。企业拆迁员工愿意跟随企业搬迁的，企业应当给予员工拆迁安置费;企业拆迁员工不愿意跟随企业搬迁需要解除劳动合同的，企业应该给予一定的经济补偿。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条，有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
(一)劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的;
(二)劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的;
(三)劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
二、
公司搬迁员工赔偿金要扣税吗
公司赔偿金是要交税的。个人因解除和用人单位的劳动关系，而取得的一次性的补偿收入，收入低于当地职工的上年度平均工资的三倍的部分，免征个人所得税。
超出部分依据相关规定，计算征收个人所得税，考虑到失业人员一次性经济补偿收入数额较大，而且被辞退人员在一段时间之内可能没有固定收入，所以是可以不用缴纳的。
三、
公司搬迁了怎么仲裁
遇到劳动的问题可以申请仲裁，申请劳动仲裁流程：
1.劳动者自权益受损之日起一年内，向当地的劳动仲裁委提交劳动仲裁申请；
2.仲裁委五日内审理并答复申请人的仲裁申请；
3.由三名仲裁员组成仲裁庭，在查明事实的基础上做出仲裁裁决。